走査型プローブ顕微鏡応用によるゲノム解析技術の開発

杉山 滋; 塚本 和己; 山内 武志; 吉野 智之; 高橋 宏和; 桑崎 誠剛; 末次 克行; 生川 潤子; 山本 公子; 大谷 敏郎

doi:10.1380/jsssj.30.427

論文

走査型プローブ顕微鏡応用によるゲノム解析技術の開発

杉山滋, 塚本和己, 山内武志, 吉野智之 ^†, 高橋宏和, 桑崎誠剛, 末次克行, 生川潤子, 山本公子, 大谷敏郎 ^†

著者情報

杉山滋
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
塚本和己
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
山内武志
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
吉野智之 ^†
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
高橋宏和
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
桑崎誠剛
独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
末次克行
独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
生川潤子
独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
山本公子
独立行政法人農業生物資源研究所昆虫科学研究領域昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
大谷敏郎 ^†
独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構食品総合研究所食品工学研究領域ナノバイオ工学ユニット
著者の貢献

†吉野智之, 大谷敏郎は本研究に等しく貢献した。

ジャーナルフリー

2009 年 30 巻 8 号 p. 427-432

DOI https://doi.org/10.1380/jsssj.30.427

詳細

抄録

Recently, in the field of genome sequencing, next generation DNA sequencers are becoming available, and even the genome sequence analysis of a higher animal and/or a plant can be finished within a short period. However, the next generation DNA sequencers can only read relatively short sequence, which causes difficulty in the assemble step (i.e. reconstruction of original genomic sequence) and makes it labor and time consuming process and results in the long time requiring for gene isolation and breeding. When a target organism does not have enough genomic information, the assemble becomes much harder or not possible. This difficulty is arisen from the absence of positional index of the obtained nucleotide sequences by a whole genome shot-gun method. Therefore, we started the development of a new, scanning probe microscope based genome analysis method that can acquire the nucleotide sequences with positional indexes on the genome.

責任著者(Corresponding author)

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